イクレイはプロジェクトやキャンペーンの実施にあたり、目標を達成し、会員を支援するために世界中のパートナーと連携しています。イクレイのサポーターは、国の政府や学術機関、財団法人、NGO、そして様々なレベルの自治体連合などです。
国連開発計画（UNDP）の協力を通して、イクレイは地方自治体の持続可能な発展の動きをUNDPの地球規模のプログラムに結びつけています。
また、国連人間居住計画（UN－HABITAT）との「優秀事例とローカルリーダーシップ」プログラムでの連携によって、イクレイは国際的な優秀事例に関する有益な情報を得てイクレイの会員と情報を共有することが可能になりました。
これらのパートナーシップは、国際機関に限らず、地域レベルでのプロジェクトにおいても重要です。